به گزارش پایگاه خبری 598، در فرآیند بازطراحی و بازسازی این ناو، تغییرات زیادی اعمال شده است. این تغییرات شامل سکو (رمپ) پرش برای برخاست پهپادها، عرشه مورب برای فرود پهپادها، اتاق کنترل پرواز، آسانسور برای جابهجایی تسلیحات و هواگردها و دیگر تجهیزات از آشیانه اصلی به روی عرشه و بالعکس میشود. همچنین، پشت دکل فرماندهی و کنترل، پد بالگرد و محلی برای قرارگیری تسلیحات در نظر گرفته شده است.
این ناو با باند پروازی به طول حدود ۱۷۰ متر، توانایی حمل و به کارگیری انواع پهپادها و بالگردها را داراست. همچنین فضای وسیعی برای حمل و استفاده از قایقهای تندرو موشکانداز و امکان استفاده به عنوان آشیانه هواگردها برای ناو در نظر گرفته شده است.
در زمینه تسلیحات، ناو پهپادبر شهید باقری به ۸ فروند موشک کوتاهبرد پدافندی، ۸ فروند موشک کروز، ۲ توپ ۲۰ میلیمتری عاصفه و یک توپ ۳۰ میلیمتری در جلو مجهز است.