متن پیام رهبر معظم انقلاب به این شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
درگذشت روحانی مُصلح و فاضل، جناب ماموستا حسامالدین مجتهدی از علمای برجسته شافعی و نماینده مجلس خبرگان رهبری و امامجمعه اهل سنت سنندج رحمةالله علیه را به عموم مردم مؤمن و انقلابی کردستان و به خانواده و بازماندگان محترم ایشان تسلیت عرض میکنم.
این شخصیت خدوم و کهنسال که بسیاری از علمای منطقه شاگردان وی به شمار میرفتند، از جمله وفاداران به پیام انقلابی اتحاد مسلمانان بوده و با روحیّه تقریب میان فِرَق اسلامی، به وظایف روحانی اشتغال داشت.
رحمت و مغفرت حق متعال را برای ایشان مسألت میکنم.
سیّدعلی خامنهای
6 اردیبهشت 1393